Церквей в Которе  семь: часовня Богородицы Здравие (ее построили пережившие эпидемию чумы жители), церковь св. Марии, собор св. мч. Трифона (IX век, в нем хранятся мощи св. мученика, купленные которским гражданином Андреа Сараценисом в начале IX века), церковь св. Луки (XII век), церковь св. Николая (начало XX века), церковь св. Анны (XII век), церковь св. Михаила (IX век).

Наиболее привлекательны и интересны для посещения Кафедральный собор Св. Трифона с сохранившимися фресками 15 века – символ Котора, посвящённый защитнику и покровителю города Св. Трифону, Морской музей, дворец Бизанти (от 17 в.), дворец Пима (от 16 в.), княжеский дворец (от 7 в.), дворец Драго (от 15 в.). Среди туристов также популярны и Остров мёртвых, и искусственный остров Богородицка Шкрпьела.

Св. Трифон - покровитель мореплавателей Боки Которской. Местное предание говорит нам о том, что  в 809 году мореплаватели везли его св. мощи, возвращаясь из похода в Малую Азию. Несколько дней продолжался сильный шторм, и они решили укрыться в Которской бухте. Жители города решили, что св. Трифон не хочет покидать эти места, так как шторм не прекращался, и поэтому богатый горожанин Сараценис выкупил мощи у венецианцев и поместил их в специально построенную маленькую церковь. Позже в городе воздвигли монументальный собор, который неоднократно перестраивался, но мощи св. мученика  (ларец с мощами и серебряный кубок с головой Святого Трифона) всегда пребывали в нем. Там же в соборе находится саркофаг, в котором похоронен почетный гражданин Котора Андреа Сараценис.

Во время страшного землетрясения 17 века башни собора обрушились, и его обломки   засыпали многие дома и даже княжеский дворец. Под обломками погибли князь и его семья.

В городе  встречаются изображения Святого Трифона, который держит в своих руках старый  Котор, демонстрируя свое покровительство городу.

В середине 17 века в городе появились православные беженцы с  полуострова Грбаль, захваченного турками. Венецианская  католическая знать не только предоставила им убежище, но и позволила проводить православные службы в  древней церкви Святого Луки. В этой церкви  соорудили второй алтарь и до начала 19 века там параллельно проводились как католическое, так и православное богослужения.